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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:27:18, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

QGC14B24.yg.ab1 QG_ABCDI lettuce salinas Lactuca sativa cDNA clone QGC14B24, mRNA sequence.
BQ859837.1:187-206
GGATGTTATAAGTTTATCAATAACACCTAA187CAGACGTCCACCTGGAATTGCAACATTTTTTAATCCAATAGACATGGCGT
QGD6K07.yg.ab1 QG_ABCDI lettuce salinas Lactuca sativa cDNA clone QGD6K07, mRNA sequence.
BQ869596.1:162-181
GGATGTTATAAGTTTATCAATAACACCTAA162CAGACGTCCACCTGGAATTGCAACATTTTTTAATCCAATAGACATGGCGT
TSA: Lactuca sativa Letassy_X1_18353 mRNA sequence.
JI575247.1:1292-1311
GGATGTTATAAGTTTATCAATAACACCTAA1292CAGACGTCCACCTGGAATTGCAACATTTTTTAATCCAATAGACATGGCGT
TSA: Lactuca serriola Serrassy_T_P2_7970 mRNA sequence.
JO021945.1:1709-1728
ACGCCATGTCTATTGGATTAAAAAATGTTG1709CAATTCCAGGTGGACGTCTGTTAGGTGTTATTGATAAACTTATAACATCC
Lactuca saligna genome assembly, chromosome: 4.
OX465080.1:29523704-29523723
ATGCCATGTCTATTGGATTAAAAAAAGTAG29523704CAATTCCAGGTGGACGTCTGTTGGGTGTTATTGATAAACTTATAACATCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAGACGTCCACCTGGAATTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAGACGTCCACCTGGAATTG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.223 | 0.215 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGACGTCCACCTGGAATTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.333 | 0.110 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAATTCCAGGTGGACGTCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.335 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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