GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:22:52, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Physalis peruviana Php00a02281.10106 mRNA sequence.
JO134198.1:1503-1522
GGAGATACAGATCTTGAAAGCAATTTTTCA1503CAGCCATCTTCTCCTGGTAGTGAAGACTTTGATAATGCTTCTATCGACAG
TSA: Physalis peruviana Php00a02281.10107 mRNA sequence.
JO134199.1:626-645
GGAGATACAGATCTTGAAAGCAATTTTTCA626CAGCCATCTTCTCCTGGTAGTGAAGACTTTGATAATGCTTCTATCGACAG
Balaenoptera acutorostrata genome assembly, chromosome: 19.
OX465369.1:64493020-64493039
AGTGGCCCAGAGTGAAGCCTTTGATAAAAT64493020CTACCAGGAGAAGATGGCTGGGCTCGCTCAAGACCTATTCCCATGGGAAT
Barbatula barbatula genome assembly, chromosome: 3.
OX344770.1:1204092-1204111
TCGCAAGAAAGTGGAACGCATCGTGGAGGA1204092CTACCAGGAGAAGATGGCTGACCTTAACAAATGCATGAAGTTCATCAAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAGCCATCTTCTCCTGGTAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAGCCATCTTCTCCTGGTAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.197 | 0.189 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGCCATCTTCTCCTGGTAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.299 | 0.102 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTACCAGGAGAAGATGGCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.301 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).