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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:03:24, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:35743323-35743342
ACGGTTTTGTCTGTGTTGAACTGTCATCAT35743323CAGGTTCCATCTGCTTATCCAATTCAGCATCATCATCGTCTTGTGATTCA
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:35244883-35244902
ACGGTTTTGTCTGTGTTGAACTGTCATCAT35244883CAGGTTCCATCTGCTTATCCAATTCAGCATCATCATCGTCTTGTGATTCA
Chenopodium album genome assembly, chromosome: 4.
OX419211.1:21287076-21287095
ATGGTTTTGTATCTGTTGAATTGTCTTCAT21287076CAGGTTCCATCTGCTTATCCAATTCAGCATCATCATCTTGTGAGTCACTC
Heliconius sara genome assembly, chromosome: 3.
OU860782.2:518115-518134
GGAACGGAGTATCTTAACAATAGGTTCCCT518115CAGGTTCCATCTGCTTATCCTGCTATGTTGCGGTACGGCAAGAAGCTAAA
Sylvilagus floridanus genome assembly, chromosome: 3.
OX463225.1:132526315-132526334
TTTCTCCAAGAAAAAAAATACAATTTATGA132526315GGATAAGCAGATGGAACCTGAAGTAAATTAATCAGAAAAATTGATTATCC
Chenopodium album genome assembly, chromosome: 13.
OX419220.1:17000765-17000784
GAGTGACTCACAAGATGATGATGCTGAATT17000765GGATAAGCAGATGGAACCTGATGAAGACAATTCAACAGATACAAAACCAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAGGTTCCATCTGCTTATCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAGGTTCCATCTGCTTATCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.361 | 0.353 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGGTTCCATCTGCTTATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.466 | 0.105 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGATAAGCAGATGGAACCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.468 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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