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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 11:48:50, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Zelleria hepariella genome assembly, chromosome: 4.
OX439382.1:11667385-11667404
TTCTTATCGCGCGCGGATTATACTAATCAT11667385CATGTATTCTGCGTGAAGTGCTTAGCTTATTATTGTATTGTATTGTCATA
Ennomos erosarius genome assembly, chromosome: 22.
OY756999.1:4819653-4819672
TCGCGCCTACTTGGTACTTGCGTTGCGATA4819653CATGTATTCTGCGTGAAGTGAAGGCCTACGTAGCGACCCAGACGCCAATG
39RDBRT_UP_048_F07_22JUL2004_053 Brassica rapa 39RDBRT Brassica rapa cDNA 5', mRNA sequence.
CX272976.1:243-262
GAGAGACATGGCTGGTCCTGCTGGGGGTGG243CACTTCACGCAGAATACATGCTCAGCATATTCGACATTTACTTCAAAACT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CATGTATTCTGCGTGAAGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CATGTATTCTGCGTGAAGTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.264 | 0.255 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATGTATTCTGCGTGAAGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.393 | 0.129 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACTTCACGCAGAATACATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.394 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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