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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-06 04:57:10, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Microchirus variegatus genome assembly, chromosome: 21.
OY735194.1:11381816-11381835
TTTGTGGAACTTTACCAACGATATGATGAA11381816CATTTGCTCACTTACCCCATTTATCCATTGTTAGGAGAGAGTGTTGTGCC
Acomys kempi genome assembly, chromosome: 9.
OU015363.1:116780278-116780297
CATCACTGCAACAGGAACCCTAAATAAGAC116780278ATGGGGTAAGTGAGCAAATGGAGAGGGAGGGAGAGAGGGAGGGAGGGAAG
EST2381 Tender roots cDNA library of tea plant Camellia sinensis cDNA clone 07102311-CHAG_26_13.M13+_E02.ab1, mRNA sequence.
GE652054.1:466-485
ACACACACACACACACAAAAGCTTTAGACG466ATGGGGTAAGTGAGCAAATGGTTAAAGCACTACTGAATACTGATCAAAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CATTTGCTCACTTACCCCAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CATTTGCTCACTTACCCCAT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.348 | 0.339 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATTTGCTCACTTACCCCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.523 | 0.175 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGGGGTAAGTGAGCAAATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.525 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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