GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:11:06, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Chionographis japonica genome assembly, chromosome: 11.
OX393559.1:5104412-5104431
ACAACCGGGGCCCACCGGACCCGACCCAAG5104412CCAAAGAAGAGGCAGAGTGGGCCCATCCTCAAGTGGGGCCCACCTAGCCC
Plecotus auritus genome assembly, chromosome: 6.
OY734027.1:157376330-157376349
CCACCGGATCTCCTGGGACTGATGCTGTTT157376330CCACTCTGCCTCTTCTTTGGCTCATTACAGCCCCTGGGTAGGGTGAGGAC
Apoda limacodes genome assembly, chromosome: 8.
OX291548.1:20671696-20671715
TATCATAGTGACTCATTTTGAGACTACTAT20671696CCACTCTGCCTCTTCTTTGGAAAAAACTTTATATTTAATGTTTTTTAAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCAAAGAAGAGGCAGAGTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCAAAGAAGAGGCAGAGTGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.197 | 0.188 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAAAGAAGAGGCAGAGTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.268 | 0.071 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCACTCTGCCTCTTCTTTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.270 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).