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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 14:37:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

PP_LBa0043-J14.R PP_LBa Prunus persica genomic 3', genomic survey sequence.
FI961755.1:256-275
CATTTGCTTTCAATATAAAATCCCACAAAA256CCAAGGTGCCAAGTCAATGTATAGTACTGCTAACATATTGCAAAATATGC
Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd04.
AP019300.1:8882602-8882621
GCATATTTTGCAATATGTTAGCAGTACTAT8882602ACATTGACTTGGCACCTTGGTTTTGTGGGATTTTATATTGAAAGCAAATG
Yponomeuta malinellus genome assembly, chromosome: 16.
OX371010.1:2076677-2076696
ATAAGACAGATTTCCAATCTTTTACGCCTA2076677ACATTGACTTGGCACCTTGGGCTTCGGATCTTTTCGAGTTTGAAAGGTAC
Yponomeuta cagnagella genome assembly, chromosome: 16.
OX371244.1:2088023-2088042
ATAAGACAGATTTCCAATCTTTTACGCCTA2088023ACATTGACTTGGCACCTTGGGCTTCGGATCTTTTCGAGTTTGAAAGGTAC
Yponomeuta cagnagella genome assembly, chromosome: 16.
OX371283.1:2112947-2112966
ATAAGACAGATTTCCAATCTTTTACGCCTA2112947ACATTGACTTGGCACCTTGGGCTTCGGATCTTTTCGAGTTTGAAAGGTAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCAAGGTGCCAAGTCAATGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCAAGGTGCCAAGTCAATGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.218 | 0.209 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAAGGTGCCAAGTCAATGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.310 | 0.092 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACATTGACTTGGCACCTTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.313 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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