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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 19:05:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Larus fuscus genome assembly, chromosome: 23.
OZ010776.1:774554-774573
ACGTAACACCCCAGATCCGGCACCCAGCAC774554CCACAATCTTGTACCCAGCACTCCACACATGCCACCCGGCACCCCAGACC
EST00175 Sporophyte cDNA Library Pyropia haitanensis cDNA 5', mRNA sequence.
DN604964.1:105-124
CGTTGGTCACCCCGTGGTGCAGGTTGTGCA105CCACAATCTTGTACCCAGCATTGGCCTTGCTGCTGCTCGCCGCCGCCACC
Chroicocephalus ridibundus genome assembly, chromosome: 21.
OZ001754.1:4371340-4371359
GGTTTGGGGTGCCGGGTGGCATGCGTGGAG4371340TGCTGGGTACAAGATTGTGGGTGCTGGGTGCCGGATCTGGGGCGTTACGT
Neoitamus cyanurus genome assembly, chromosome: 7.
OX384546.1:26118088-26118107
TGTTACCGAAAGCTTCCAGCTATCGAAGGA26118088TGCTGGGTACAAGATTGTGGCCCATATGATGCCAGATCTGCCTAACGTTG
Dysmachus trigonus genome assembly, chromosome: 3.
OX454321.1:12966898-12966917
TGTTTGCGAAAGCTTCCAGCTGTCGAAGGA12966898TGCTGGGTACAAGATTGTGGCTCATATGATGCCTGATCTGCCTAACGTGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCACAATCttGTACCCAGCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCACAATCttGTACCCAGCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.401 | 0.392 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCACAATCTTGTACCCAGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.498 | 0.097 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCTGGGTACAAGATTGTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.500 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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