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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-16 00:32:38, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

VVS4 Grapevine (M. Thomas) Vitis vinifera STS genomic, sequence tagged site.
G64024.1:1-24
1CCATCAGTGATAAAACCTAATGCCAGGTTGGAGAGAGGGAGATTGTTCAAATAA
Vitis vinifera contig VV78X147810.38, whole genome shotgun sequence.
AM485766.2:1471-1494
TTCTTTGAACAATCTCCCTCTCTCCAACCT1471GGCATTAGGTTTTATCACTGATGGAGCACCATATCTACCTAAGTTTGATTCTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCATCAGTGATAAAACCTAATGCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCATCAGTGATAAAACCTAATGCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.109 | 0.101 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCATCAGTGATAAAACCTAATGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.143 | 0.034 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCATTAGGTTTTATCACTGATGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.144 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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