GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:50:54, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Porphyra yezoensis cDNA, clone:PF025c08_r, 5'end.
AU188383.1:457-476
GCTGCGCGGCGCGGGTCTTCATGGCCGATG457CCGCCTTTGCACATACTCTCTCGCGCCGTTTGTCCCCTCCCCAGGTGCGC
Porphyra yezoensis cDNA clone:PM016e06_r, 5' end.
AV432555.1:431-450
GCTGCGCGGCGCGGGTCTTCATGGCCGATG431CCGCCTTTGCACATACTCTCTCGCGCCGTTTGTCCCCTCCCCAGGTGCGC
Porphyra yezoensis cDNA clone:PM030c12_r, 5' end.
AV433528.1:424-443
GCGCACCTGGGGAGGGGACAAACGGCGCGA424GAGAGTATGTGCAAAGGCGGCATCGGCCATGAAGACCCGCGCCGCGCAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCGCCTTTGCACATACTCTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCGCCTTTGCACATACTCTC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.317 | 0.308 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCGCCTTTGCACATACTCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.427 | 0.110 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGAGTATGTGCAAAGGCGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.428 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).