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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-06 07:25:50, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

EG-A11_001_A07 Oil palm abnormal apex Lambda Zap Library Elaeis guineensis cDNA, mRNA sequence.
CN599688.1:160-179
ACCCTCTCCGCCGCCCCCCGCCTCGCTGCC160CGATCCCTTTGCTTCAAGTCCAGCCTCAGATCAGATGGGACCGCTGCCTT
Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig45679.
LM641813.1:74-93
ACCCTCTCCGCCGCCCCCCGCCTCGCTGCC74CGATCCCTTTGCTTCAAGTCCAGCCTCAGATCGGATGGGACCGCTGCCTT
Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig03028.
LM621907.1:1198-1217
AAGGCAGCGGTCCCATCCGATCTGAGGCTG1198GACTTGAAGCAAAGGGATCGGGCAGCGAGGCGGGGGGCGGCGGAGAGGGT
Tridacna gigas genome assembly, chromosome: 1.
OX244028.2:31899475-31899494
AGCCCAAATATCTCAGTCCTTAACGTAAGG31899475GACTTGAAGCAAAGGGATCGCTGGTTCCAATCCCCACCTCGCCTATTTCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGATCCCTTTGCTTCAAGTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGATCCCTTTGCTTCAAGTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.531 | 0.523 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGATCCCTTTGCTTCAAGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.734 | 0.203 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACTTGAAGCAAAGGGATCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.736 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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