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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:39:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Lactuca serriola Serrassy_T_P2_10489 mRNA sequence.
JO024544.1:85-104
GGTACAAATTTCATTATCACACACCCCACA85CGCAACCAACCAAATTTACCCTTTTACATTTTATACCGTATGTGAGACTT
QGA6F11.yg.ab1 QG_ABCDI lettuce salinas Lactuca sativa cDNA clone QGA6F11, mRNA sequence.
BQ848122.1:303-322
AAGTCTCACATACGGTATAAAATGTAAAAG303GGTAAATTTGGTTGGTTGCGTGTGGGGTGTGTGATAATGAAATTTGTACC
QGC14I11.yg.ab1 QG_ABCDI lettuce salinas Lactuca sativa cDNA clone QGC14I11, mRNA sequence.
BQ859980.1:303-322
AAGTCTCACATACGGTATAAAATGTAAAAG303GGTAAATTTGGTTGGTTGCGTGTGGGGTGTGTGATAATGAAATTTGTACC
QGE17E22.yg.ab1 QG_EFGHJ lettuce serriola Lactuca serriola cDNA clone QGE17E22, mRNA sequence.
BQ982761.1:246-265
AAGTCTCACATACGGTATAAAATGTAAAAG246GGTAAATTTGGTTGGTTGCGTGTGGGGTGTGCGATAATGAAATTTGTACC
QGE5I09.yg.ab1 QG_EFGHJ lettuce serriola Lactuca serriola cDNA clone QGE5I09, mRNA sequence.
BQ984952.1:548-567
AAGTCTCACATACGGTATAAAATGTAAAAG548GGTAAATTTGGTTGGTTGCGTGTGGGGTGTGTGATAATGAAATTTGTACC
QGH12O23.yg.ab1 QG_EFGHJ lettuce serriola Lactuca serriola cDNA clone QGH12O23, mRNA sequence.
BU006957.1:548-567
AAGTCTCACATATGGTATAAAATGTAAAAG548GGTAAATTTGGTTGGTTGCGTGTGGGGTGTGTGATAATGAAATTTGTACC
QGH7B02.yg.ab1 QG_EFGHJ lettuce serriola Lactuca serriola cDNA clone QGH7B02, mRNA sequence.
BU008266.1:547-566
AAGTCTCACATACGGTATAAAATGTAAAAG547GGTAAATTTGGTTGGTTGCGTGTGGGGTGTGTGATAATGAAATTTGTACC
QGJ4P16.yg.ab1 QG_EFGHJ lettuce serriola Lactuca serriola cDNA clone QGJ4P16, mRNA sequence.
BU013562.1:548-567
AAGTCTCACATACGGTATAAAATGTAAAAG548GGTAAATTTGGTTGGTTGCGTGTGGGGTGTGTGATAATGAAATTTGTACC
CLLX14525.b1_J08.ab1 CLL(XYZ) lettuce saligna Lactuca saligna cDNA clone CLLX14525, mRNA sequence.
DW047895.1:298-317
AAGTCTCACATACGGTATAAAATGTAAAAG298GGTAAATTTGGTTGGTTGCGTGTGGGGTGTGTGATAATGAAATTTGTACC
TSA: Lactuca sativa Letassy_X1_1317 mRNA sequence.
JI578033.1:2155-2174
AAGTCTCACATACGGTATAAAATGTAAAAG2155GGTAAATTTGGTTGGTTGCGTGTGGGGTGTGTGATAATGAAATTTGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGCAACCAACCAAATTTACC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGCAACCAACCAAATTTACC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.190 | 0.181 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGCAACCAACCAAATTTACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.518 | 0.328 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTAAATTTGGTTGGTTGCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.524 | 0.006 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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