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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:49:41, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

CA00-XX-IA2-002-F12-EC.F Coffea arabica IA2 Coffea arabica cDNA clone CA00-XX-IA2-002-F12-EC, mRNA sequence.
GW440278.1:40-63
AAGAAAGAGAGATGCTGGGGCCTGTCTTTG40CGCTTGACGTATCCTTTGGCCTCTTTCTCGGAGTAGCAGTGGTATCCCTTCTCC
CGN-47495 Seed of Late Development Stage Coffea canephora cDNA clone cccs46w24o12 5', mRNA sequence.
DV701322.1:684-707
GGAGAAGGGATACCACTGCTACTCCGAGAA684AGAGGCCAAAGGATACGTCAAGCGCAAAGACAGGGCCCAGCATCTCTCTTTCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGCTTGACGTATCCTTTGGCCTCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGCTTGACGTATCCTTTGGCCTCT | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.258 | 0.249 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGCTTGACGTATCCTTTGGCCTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.417 | 0.159 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGAGGCCAAAGGATACGTCAAGCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.418 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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