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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:25:43, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 4.
CP093346.1:44719460-44719482
GGTGGGTTGTTAAGCAACTTGTAATAGTTA44719460CGGATATTGGACTTGAATCTGGGGACATAAACCTCGTCATTTTCAAGGGACTG
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 4.
CP125304.1:33009325-33009347
GGTGGGTTGTTAAGCAACTTGTAATAGTTA33009325CGGATATTGGACTTGAATCTGGGGACATAAACCTCGTCATTTTCAAGGGACTG
KYERRC001_05-A07-T3.ab1 Panax ginseng in vitro-cultured adventitious root cDNA library Panax ginseng cDNA, mRNA sequence.
HS076411.1:773-795
CCAATCCCTTGAAAATGATGAGGTTTATGT773CCCAGATTCAAGTCCAATATCCGAAACTATTACAAAATCCTCGATAACCCACC
Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 4.
CP093346.1:44689064-44689086
CAGTCCCTTGAAAATGACGAGGTTTATGTC44689064CCCAGATTCAAGTCCAATATCCGTAACTATTACAAGTTGCTTAACAACCCACC
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 4.
CP125304.1:32978058-32978080
CAGTCCCTTGAAAATGACGAGGTTTATGTC32978058CCCAGATTCAAGTCCAATATCCGTAACTATTACAAGTTGCTTAACAACCCACC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGGATATTGGACTTGAATCTGGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGGATATTGGACTTGAATCTGGG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.238 | 0.230 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGGATATTGGACTTGAATCTGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.439 | 0.201 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCAGATTCAAGTCCAATATCCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.441 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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