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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 14:57:34, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig39417 mRNA sequence.
JW089661.1:317-338
AAGTGGTTCCACATCTACATTTGAACCCGA317CTAATCCCACCTTCTTTCTACAAACCGAACACCTATTCAATTGAACATGTGT
TSA: Capsicum annuum EJ_MegaContig_438, mRNA sequence.
JW128718.1:307-328
AAGTGGTTCCACATCTACATTTGAACCCGA307CTAATCCCACCTTCTTTCTACAAACCGAACACCTATTCAATTGAACATGTGT
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 10, sequence.
AP026705.1:226732273-226732294
AAGTGGTTCCACATCTACATTTGAACCCGA226732273CTAATCCCACCTTCTTTCTACAAACCGAACACCTATTCAATTGAACATGTGT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 10.
CP124722.1:231530393-231530414
AAGTGGTTCCACATCTACATTTGAACCCGA231530393CTAATCCCACCTTCTTTCTACAAACCGAACACCTATTCAATTGAACATGTGT
KS17060G07 KS17 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD081161.1:518-539
ACACATGTTCAATTGAATAGGTGTTCGGTT518TGTAGAAAGAAGGTGGGATTAGTCGGGTTCAAATGTAGATGTGGAACCACTT
KS20064C01 KS20 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD099184.1:576-597
ACACATGTTCAATTGAATAGGTGTTCGGTT576TGTAGAAAGAAGGTGGGATTAGTCGGGTTCAAATGTAGATGTGGAACCACTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTAATCCCACCTTCTTTCTACA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTAATCCCACCTTCTTTCTACA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.199 | 0.190 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTAATCCCACCTTCTTTCTACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.483 | 0.284 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTAGAAAGAAGGTGGGATTAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.484 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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