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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 13:10:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Pyrus x bretschneideri Unigene25938_XinShao mRNA sequence.
JR619480.1:390-409
CGTCAAAACATTCAGAGCCGCGCCCTTCTG390CTACCCTCAGCTGAACCCAATCTGTCAAATCAACCCCATTTCCTTCACCT
Geranium rotundifolium genome assembly, chromosome: 9.
OY987319.1:3588523-3588542
TTTAATCATCTACAGACTTTGCACTACATT3588523CTACCCTCAGCTGAACCCAACCCAACTGCTCAGTTGGTCAAGGTGATTAA
TSA: Pyrus communis mRNA, contig: lc31862.
FX639931.1:227-246
AGGTGAAGGAAATGGGGTTGATTTGACAGA227TTGGGTTCAGCTGAGGGTAGCAGAAGGGCGCGGCTCTGAATGTTTTGACG
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 2.
OY757069.1:5765309-5765328
AGGTGAAGGAAATGGGGTTGATTTGACAGA5765309TTGGGTTCAGCTGAGGGTAGCAGAAGGGCGCGGCTCTGAATGTTTTGACG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTACCCTCAGCTGAACCCAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTACCCTCAGCTGAACCCAA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.179 | 0.171 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTACCCTCAGCTGAACCCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.280 | 0.101 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGGGTTCAGCTGAGGGTAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.281 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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