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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-06 11:30:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

NXNV_066_D01_F Nsf Xylem Normal wood Vertical Pinus taeda cDNA clone NXNV_066_D01 5', mRNA sequence.
AW698105.1:46-64
TTCACACCCCAACTGGAAAGCACAGAAGGC46CTCTAGCGACCATTTATTCCGTTAACCGGCTCGTCCCGGGTTCGAGCCA
RTCA1_20_H12.b1_A029 Roots minus calcium Pinus taeda cDNA clone RTCA1_20_H12_A029 3', mRNA sequence.
DR054916.1:692-710
TGGCTCGAACCCGGGACGAGCCTGTTAACG692GAATAAATGGTCGCTAGAGGCCTTCTGTGCTTTCCAGTTGGGGTGTGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCTAGCGACCATTTATTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCTAGCGACCATTTATTC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.175 | 0.167 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCTAGCGACCATTTATTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.319 | 0.144 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAATAAATGGTCGCTAGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.319 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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