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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:03:23, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Canis lupus genome assembly, chromosome: 14.
HG994400.1:117127-117146
AGTCATTTCTTGTCCTTTGGTTGGCTGGAA117127CTGCTGCTCCAACTTTCAGACACAGGCTCCCGTGGACATGTAGTAAATCC
Canis Familiaris chromosome 14, clone XX-66K24, complete sequence.
AC187317.7:143473-143492
GGATTTACTACATGTCCACGGGAGCCTGTG143473TCTGAAAGTTGGAGCAGCAGTTCCAGCCAACCAAAGGACAAGAAATGACT
Canis lupus familiaris breed Labrador retriever chromosome 14a.
CP050589.1:62437402-62437421
GGATTTACTACATGTCCACGGGAGCCTGTG62437402TCTGAAAGTTGGAGCAGCAGTTCCAGCCAACCAAAGGACAAGAAATGACT
Canis lupus familiaris breed Labrador retriever chromosome 14b.
CP050623.1:62438835-62438854
GGATTTACTACATGCCCACGGGAGCCTGTG62438835TCTGAAAGTTGGAGCAGCAGTTCCAGCCAACCAAAGGACAAGAAATGACT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGCTGCTCCAACTTTCAGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGCTGCTCCAACTTTCAGA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.130 | 0.121 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGCTGCTCCAACTTTCAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.186 | 0.056 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTGAAAGTTGGAGCAGCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.188 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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