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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:36:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Larus fuscus genome assembly, chromosome: 3.
OZ010755.1:102460945-102460964
CCTGAATGGGCACATTCACTGCACACCAAC102460945CTGGTTGATGTTAGCTGCACATTGGGTGAAAGCATCTTCCATCTCCTCCC
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:97602179-97602198
AACCTAAAGTATCCCTAATAATCAGATGAA97602179CTGGTTGATGTTAGCTGCACGAGTGCACAACTACAAGACGTCATACTAGA
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:91818517-91818536
TCTAGTATGACGTCTTGTAGTTGTGCACTC91818517GTGCAGCTAACATCAACCAGTTCATCTGATTATTAGGGATACTTTAGGTT
Agriotes lineatus genome assembly, chromosome: 2.
OW679195.1:21198732-21198751
AATGTCAAACGTTCAAACATAACACTGCAC21198732GTGCAGCTAACATCAACCAGTTAAAATAACTAGCGCCAAATAAATGACCA
Lathronympha strigana genome assembly, chromosome: 5.
OX421906.1:24082409-24082428
TCCTGACGACAGAAGAACGGGAGTGTGCTG24082409GTGCAGCTAACATCAACCAGTGCGCCCGCGGCCGTCAGTGAATGACAATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGGTTGATGTTAGCTGCAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGGTTGATGTTAGCTGCAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.174 | 0.165 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGGTTGATGTTAGCTGCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.266 | 0.092 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGCAGCTAACATCAACCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.268 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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