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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:39:53, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

84-L109828-1033-175-G21-ccfw IGS-SCF-1033 Bvu-KWS2320 fosmid genomic library Beta vulgaris subsp. vulgaris genomic clone IGS-SCF-1033-175-G21 5', genomic survey sequence.
JY393292.1:204-223
TTTGTTTTGCATCTAGCAACTGTACCCAAA204CTTAGTGCCTTGAAGGCTTGAATCTCACAATCCAGCATATTGTAATCTCT
Esperia sulphurella genome assembly, chromosome: 25.
OX352282.1:3688852-3688871
GAGAGCCTTAAAGGCTATCGAGCCTTGAAG3688852CTTAGTGCCTTGAAGGCTTGAGCCTTTAAGGCTTGGTAGCTGCGGCTGGA
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 1.
OX392547.1:437295-437314
AGAGATTACAATATGCTGGATTGTGAGATT437295CAAGCCTTCAAGGCACTAAGTTTGGGTACAGTTGCTAGATGCAAAACAAA
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 1.
OX392556.1:419258-419277
AGAGATTACAATATGCTGGATTGTGAGATT419258CAAGCCTTCAAGGCACTAAGTTTGGGTACAGTTGCTAGATGCAAAACAAA
Esperia sulphurella genome assembly, chromosome: 20.
OX352277.1:952676-952695
TAGTTGTGAGAAGATTCGGCCTTGAAGGCT952676CAAGCCTTCAAGGCACTAAGCTTTCAAAACTAGAGCCTAAAAGGACTTCC
Esperia sulphurella genome assembly, chromosome: 25.
OX352282.1:9234373-9234392
AAGCTTTCAAGGCACTGATACTTCAAAGCT9234373CAAGCCTTCAAGGCACTAAGACATCAGAGTTCCAAACAGGCTTGGAGCCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTAGTGCCTTGAAGGCTTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTAGTGCCTTGAAGGCTTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.271 | 0.262 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTAGTGCCTTGAAGGCTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.369 | 0.099 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAGCCTTCAAGGCACTAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.372 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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