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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:53:44, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ophion ventricosus genome assembly, chromosome: 6.
OZ010716.1:24795258-24795277
ACCAAAAGATGACTCCTCCAATGAGGCGAT24795258CTTGCTCGAAGTCCCGATGTCTCACTACCTCCACGAATTTTAGGTACAAA
EST3288 Tender roots cDNA library of tea plant Camellia sinensis cDNA clone 08012802-OUYI_CHAG_39_83.M13+_C11, mRNA sequence.
GE652961.1:285-304
TCTTCAAGGTGTTGAAACAGGTTCATCCGG285ACATCGGGACTTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAAC
Pyrrhosoma nymphula genome assembly, chromosome: 7.
OY754334.1:64689427-64689446
TCGCTTCCCTTTCTCCTTATGGCCCTTCCA64689427ACATCGGGACTTCGAGCAAGAGGATCCCATCGATCCAACCCGACCATTCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTGCTCGAAGTCCCGATGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTGCTCGAAGTCCCGATGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.268 | 0.260 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGCTCGAAGTCCCGATGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.424 | 0.156 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACATCGGGACTTCGAGCAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.426 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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