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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 20:59:30, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Sciurus vulgaris genome assembly, chromosome: 14.
LR738625.1:40551561-40551580
CATGGACCAAAGTCTCTGGGTATTTTCCTG40551561GAACTTCCGCTTCCTTCCTCTTCTCTAAGATGGTAGGTGGGTGGGCCGAA
Ciona intestinalis cDNA, clone:rcieg45f19, 3' end, single read.
AV866321.1:111-130
TCTGAATCCTCTGTTCCTGATGAAGAAGAT111GAACTTCCGCTTCCTTCCTCCTCGCTCTCACTGGAGTCCTCATCAGAGTA
Ciona intestinalis cDNA, clone:cigd041h03, 5' end, single read.
BW290476.1:187-206
TACTCTGATGAGGACTCCAGTGAGAGCGAG187GAGGAAGGAAGCGGAAGTTCATCTTCTTCATCAGGAACAGAGGATTCAGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAACTTCCGCTTCCTTCCTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAACTTCCGCTTCCTTCCTC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.188 | 0.180 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAACTTCCGCTTCCTTCCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.325 | 0.137 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGGAAGGAAGCGGAAGTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.326 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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