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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 07:57:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Arachis hypogaea Ahy.Unigene35840 mRNA sequence.
JR573198.1:1308-1327
TGTATGTCATAAAGAAGGTGGCCTTCATTG1308GAATCGAAACTCCGATGGTTCTAGGAATCTGTGTAGCTGACTGGTGAAGG
TSA: Arachis hypogaea Ahy.Unigene51052 mRNA sequence.
JR585172.1:985-1004
TGTATGTCATAAAGAAGGTGGCCTTCATTG985GAATCGAAACTCCGATGGTTCTAGGAATCTGTGTAGCTGACTGGTGAAGG
Arachis hypogaea DNA, clone: 8iHA03O09, cultivar: YI-0311.
DE998521.1:10-29
CCTTCATTG10GAATCGAAACTCCGATGGTTCTAGGAATCCTGTTACCAATAAGTAGAAAA
TSA: Arachis hypogaea CL17138Contig1.Arhy mRNA sequence.
EZ750919.1:111-130
CCTTCACCAGTCAGCTACACAGATTCCTAG111AACCATCGGAGTTTCGATTCCAATGAAGGCCACCTTCTTTATGACATACA
TSA: Arachis hypogaea Ahy.Unigene59077 mRNA sequence.
JR590649.1:1135-1154
CCTTCACCAGTCAGCTACACAGATTCCTAG1135AACCATCGGAGTTTCGATTCCAATGAAGGCCACCTTCTTTATGACATACA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A05.
CP030987.1:194112-194131
TTTTCTACTTATTGGTAACAGGATTCCTAG194112AACCATCGGAGTTTCGATTCCAATGAAGGCCACCTTCTTTATGACATACA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 05.
CP049896.1:1895919-1895938
TTTTCTACTTATTGGTAACAGGATTCCTAG1895919AACCATCGGAGTTTCGATTCCAATGAAGGCCACCTTCTTTATGACATACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAATCGAAACTCCGATGGTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAATCGAAACTCCGATGGTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.216 | 0.207 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAATCGAAACTCCGATGGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.257 | 0.041 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACCATCGGAGTTTCGATTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.259 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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