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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 15:59:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:4279264-4279285
GTCGAGTCCTATCAGCTGCGAATTGATCGA4279264GAATGACTCAAGCGTAGACCTGCGTAACTTTCTTGGTTGGTTATAAACTTAT
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:4245669-4245690
GTCGAGTCCTATCAGCTGCGAATTGATCGA4245669GAATGACTCAAGCGTAGACCTGCGTAACTTTCTTGGTTGGTTATAAACTTAT
Chionographis japonica genome assembly, chromosome: 2.
OX393550.1:28990283-28990304
GTTCCTCCTTGATAGCTGCCGGCAGTACAT28990283CAGGTCTACGCTTGAGTCATTCTAGGATGAGGGTTTTGGCGCTCTCCAAGAT
Chionographis japonica genome assembly, chromosome: 2.
OX393550.1:62709054-62709075
GTTCCTCCTTGATAGTTGTCGGCAGTACAT62709054CAGGTCTACGCTTGAGTCATTCCAGGACGATGGTTTTGACGCTCTCCAAGAT
Chionographis japonica genome assembly, chromosome: 8.
OX393556.1:6246522-6246543
GTTCCTTCTTGATAGCTGCCGGCAACACAT6246522CAGGTCTACGCTTGAGTCATTCTAGGATGAGGGTTTTGGCGCTCTCCAATAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAATGACTCAAGCGTAGACCTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAATGACTCAAGCGTAGACCTG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.301 | 0.292 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAATGACTCAAGCGTAGACCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.412 | 0.111 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGGTCTACGCTTGAGTCATTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.414 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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