GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:21:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

EST1075431 GH_TMO Gossypium hirsutum cDNA, mRNA sequence.
DT564791.1:207-226
CAACCCCAGCAACGCCAAGATGATTCGGAC207GACTCCCACCCTAACAACAGCGCTATCTCTGACTTTGACAGTGCCCAATT
UFL_082_61 Cotton fiber 0-10 day post anthesis Gossypium hirsutum cDNA, mRNA sequence.
ES841942.1:253-272
CAACCCCAGCAACGCCAAGATGATTCGGAC253GACTCCCACCCTAACAACAGCGCTATCTCTGACTTTGACAGTGCCCAATT
Gossypium raimondii isolate D5-4 chromosome D5_01.
CP032553.1:51331295-51331314
CAACCACAGCAACGCCAAGATGATTCGGAC51331295GACTCCCACCCTAACAACAGCGCTATCTCTGACTTTGACAGTGCCCAATT
Gossypium rotundifolium isolate GPK201 chromosome 1.
CP106722.1:12228500-12228519
AATTGGGCACTGTCAAAGTCAGAGATAGCG12228500CTGTTGTTAGGGTGGGAGTCGTCCGAATCACCTTGGCGTTGCTGGGGTTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GACTCCCACCCTAACAACAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GACTCCCACCCTAACAACAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.264 | 0.255 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACTCCCACCCTAACAACAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.353 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGTTGTTAGGGTGGGAGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.353 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).