GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:48:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A04.
CP030986.1:4471174-4471193
TGACATAGAGACTGGTGAAATGGTGAGGAA4471174GAGAAGCCTTCAAGCAGTCGTTTAAGGTTAGGGCTACTCTCTCTCTCTCT
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B03.
CP030995.1:35841178-35841197
TGACGTAGAGACTGGTGAAATCGTGATGAA35841178GAGAAGCCTTCAAGCAGTCGTTTAAGGTTAGGGCTATTCTCTCTCTCTCT
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 03.
CP049894.1:36011592-36011611
TGACGTAGAGACTGGTGAAATCGTGATGAA36011592GAGAAGCCTTCAAGCAGTCGTTTAAGGTTAGGGCTATTCTCTCTCTCTCT
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS41B21.
DH961623.1:301-320
AGAGAGAGAGAGAGTAACCCTACCCTTAAA301CGACTGCTTGAAGGCTTCTCTTCCTCACCATTTCACCAGCCTCTATGTCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAGAAGCCTTCAAGCAGTCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAGAAGCCTTCAAGCAGTCG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.168 | 0.159 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGAAGCCTTCAAGCAGTCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.272 | 0.105 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGACTGCTTGAAGGCTTCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.273 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).