GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 13:00:36, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Humulus lupulus genome assembly, chromosome: X.
OY720650.1:205877322-205877341
GCTGAAGACATATGAGTACTAAACCTCAAC205877322GAGAGACTCGGTTGAGCATTGGAAAACTCCATAATTTCGAATTCTTAAGT
Cybosia mesomella genome assembly, chromosome: 20.
OX276408.1:28215204-28215223
ACATCCGCAACTGTACTGTGACCGTCGGGC28215204GAGAGACTCGGTTGAGCATTTTTCGTTATTTCTATAGTTTCGGATTTGGC
CSATR1JP-T3-026_L08_19DEC2008_022 CSATR1JP Cannabis sativa cDNA, mRNA sequence.
JK497676.1:207-226
TTTTTTTGTTGTTGACATATGGAGTTTTCC207AATGCTCAACCGAGTCTCTCGTTGGGGTTTAGTACTCATATGTCTTCAGC
TSA: Cannabis sativa PK11736.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449800.1:198-217
TTTTTTTGTTGTTGACATATGGAGTTTTCC198AATGCTCAACCGAGTCTCTCGTTGGGGTTTAGTACTCATATGTCTTCAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAGAGACTCGGTTGAGCATT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAGAGACTCGGTTGAGCATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.149 | 0.140 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGAGACTCGGTTGAGCATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.334 | 0.186 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATGCTCAACCGAGTCTCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.336 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).