GGGenome | Results

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2025-04-06 11:59:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica oleracea var. alboglabra EST, clone AAFC_WHRI_BoE02a003G09_SP6.
AM385382.1:25-44

AAGATGCAATTTAGTTTCTTTATT25GATATGGCATCAAAGGCCCTCTAATTACATAAAAGAAAGTAAGTAAACGG

Brassica oleracea var. alboglabra EST, clone AAFC_WHRI_BoE02a004G23_SP6.
AM385541.1:23-42

GATGCAATTTAGTTTCTTTATT23GATATGGCATCAAAGGCCCTCTAATTACATAAAAGAAAGTAAGTAAACGG

Brassica oleracea var. alboglabra EST, clone AAFC_WHRI_BoE02a004N19_SP6.
AM385606.1:25-44

AAGATGCAATTTAGTTTCTTTATT25GATATGGCATCAAAGGCCCTCTAATTACATAAAAGAAAGTAAGTAAACGG

Brassica oleracea var. alboglabra EST, clone AAFC_WHRI_BoE02a015G20_SP6.
AM387212.1:23-42

AATGCAATTTAGTTTCTTTATT23GATATGGCATCAAAGGCCCTCTAATTACATAAAAGAAAGTAAGTAAACGG

Brassica oleracea var. alboglabra EST, clone AAFC_WHRI_BoE02a018A23_SP6.
AM387620.1:25-44

AAGATGCAATTTAGTTTCTTTATT25GATATGGCATCAAAGGCCCTCTAATTACATAAAAGAAAGTAAGTAAACGG

Brassica oleracea var. alboglabra EST, clone AAFC_WHRI_BoE02a018I22_SP6.
AM387699.1:23-42

GATGCAATTTAGTTTCTTTATT23GATATGGCATCAAAGGCCCTCTAATTACATAAAAGAAAGTAAGTAAACGG

Brassica oleracea HDEM genome, scaffold: C5.
LR031877.1:46431330-46431349

TCATCTAAGATGCAATTTAGTTTCTTTATT46431330GATATGGCATCAAAGGCCCTCTAATTACATAAAAGAAAGTAAGTAAACGG

Brassica oleracea var. alboglabra EST, clone AAFC_WHRI_BoE02a015G20_T7.
AM391108.1:209-228

CCGTTTACTTACTTTCTTTTATGTAATTAG209AGGGCCTTTGATGCCATATCAATAAAGAAACTAAATTGCATCTT

Brassica oleracea var. alboglabra EST, clone AAFC_WHRI_BoE02a020E14_T7.
AM392141.1:381-400

CCGTTTACTTACTTTCTTTTATGTAATTAG381AGGGCCTTTGATGCCATATCAATAAAGAAACTAAATTGCATCTT

49RDOAT_UP_006_D12_28SEP2004_090 O. Alba 49RDOAT Brassica oleracea cDNA 5', mRNA sequence.
EE534168.1:220-239

CCGTTTACTTACTTTCTTTTATGTAATTAG220AGGGCCTTTGATGCCATATCAATAAAGAAACTAAATTGCATCTTAAAAAA

1106162274876 Cryptosporidium muris (strain RN66) cDNA library, stage oocyst Cryptosporidium muris RN66 cDNA clone 1061038766024, mRNA sequence.
FD394354.1:794-813

CCGTTTACTTACTTTCTTTTATGTAATTAG794AGGGCCTTTGATGCCATATCAATAAAGAAACTAAATTGCATCTTATAAAA

Data Export:

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Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GATATGGCATCAAAGGCCCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GATATGGCATCAAAGGCCCT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.366 | 0.358 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATATGGCATCAAAGGCCCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.595 | 0.229 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGGCCTTTGATGCCATATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=43
0.598 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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