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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-09 22:38:39, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_036_J11, 5'end.
DB932929.1:508-529
GAGAAAACCTTGACCATCTGCAGAGAGCCA508GCAAGCACCAGCAACAGACTCAACCCAAGAAAAGGGTGGCTCCTGTTGCCCC
U_UZ-100602_plate40l16.b1 Full-length enriched cDNA library of cassava MPER417-003 Manihot esculenta subsp. peruviana cDNA, mRNA sequence.
JK000667.1:248-269
AGAGAAACCTTGACCATCTGCAGAGAGCCA248GCAAGCACCAGCAACAGACTCAACCCAAGAAAAGGGTGGCTCCTGTTGCCCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCAAGCACCAGCAACAGACTCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCAAGCACCAGCAACAGACTCA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.472 | 0.464 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAAGCACCAGCAACAGACTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.558 | 0.086 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAGTCTGTTGCTGGTGCTTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.558 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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