GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-25 18:03:14, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Vigna angularis mRNA, clone: VEPS10_I04.
HX942297.1:828-847
CTTAAGAAACTCACTTATGAGGAGAGAAAG828GCTAAATTGGTTGCACGGTTGCAGGCTCTCAACTCTGCTGCTGGTGATGA
Vigna angularis mRNA, clone: VES06A21.
HX944363.1:307-326
TCATCACCAGCAGCAGAGTTGAGAGCCTGC307AACCGTGCAACCAATTTAGCCTTTCTCTCCTCATAAGTGAGTTTCTTAAG
Vigna angularis var. angularis DNA, chromosome 9, almost complete sequence, cultivar: Shumari.
AP015042.1:29156090-29156109
TCATCACCAGCAGCAGAGTTGAGAGCCTGC29156090AACCGTGCAACCAATTTAGCCTTTCTCTCCTCATAAGTGAGTTTCTTAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTAAATTGGTTGCACGGTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTAAATTGGTTGCACGGTT | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.425 | 0.416 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTAAATTGGTTGCACGGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.608 | 0.183 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACCGTGCAACCAATTTAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.609 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).