GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-05 00:57:57, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Vigna angularis mRNA, clone: VEPS10_I04.
HX942297.1:828-847
CTTAAGAAACTCACTTATGAGGAGAGAAAG828GCTAAATTGGTTGCACGGTTGCAGGCTCTCAACTCTGCTGCTGGTGATGA
Vigna mungo isolate Urdbean chromosome 3.
CP144698.1:3588008-3588027
CTTAAGAAACTCACTTATGAGGAGAGAAAG3588008GCTAAATTGGTTGCACGGTTGCAGGCTCTCAACTCTGCTGCTGGTGATGA
Vigna angularis mRNA, clone: VES06A21.
HX944363.1:307-326
TCATCACCAGCAGCAGAGTTGAGAGCCTGC307AACCGTGCAACCAATTTAGCCTTTCTCTCCTCATAAGTGAGTTTCTTAAG
Vigna angularis var. angularis DNA, chromosome 9, almost complete sequence, cultivar: Shumari.
AP015042.1:29156090-29156109
TCATCACCAGCAGCAGAGTTGAGAGCCTGC29156090AACCGTGCAACCAATTTAGCCTTTCTCTCCTCATAAGTGAGTTTCTTAAG
Lycium barbarum cultivar Ningqi No.1 chromosome 08.
CP145793.1:123183360-123183379
GACCGTCTGGTATAGCTCCAGCCTGTGCTA123183360AACCGTGCAACCAATTTAGCACCTGTGCCATAGCATCTGGTATTCCCTAA
Convolutriloba macropyga genome assembly, chromosome: 5.
OZ077303.1:59623054-59623073
GTAAGACACTGCTTGCTACTTTTCCAGTGC59623054AACCGTGCAACCAATTTAGCTCTTTTTTTCTAAAAGAAATAATCACAAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTAAATTGGTTGCACGGTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTAAATTGGTTGCACGGTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.293 | 0.284 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GCTAAATTGGTTGCACGGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.473 | 0.181 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=AACCGTGCAACCAATTTAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.476 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).