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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 18:39:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Triticum aestivum genome assembly, chromosome: 7D.
OV100757.1:636521347-636521367
AGCTGGCTTTTGGCTTAACAAGTTTCTTAA636521347GCTACAAACTTTGTTGTACCCATTTACGCGGCCCATGAAAGAGCACACCTC
Triticum aestivum genome assembly, chromosome: 7D.
OW530330.1:636521347-636521367
AGCTGGCTTTTGGCTTAACAAGTTTCTTAA636521347GCTACAAACTTTGTTGTACCCATTTACGCGGCCCATGAAAGAGCACACCTC
Populus nigra genome assembly, chromosome: 8.
OX637679.1:21499287-21499307
TACCCTCTTACAAATGCAAACAAAAAACAG21499287GCTACAAACTTTGTTGTACCCAACAAAACATGAGAGCAACTCTCTCTCTCT
Populus nigra mRNA, clone: PnFL2-056_J22, 5'end.
DB884780.1:107-127
AGAGAGAGAGAGTTGCTCTCATGTTTTGTT107GGGTACAACAAAGTTTGTAGCCTGTTTTTTGTTTGCATTTGTAAGAGGGTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTACAAACTTTGTTGTACCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTACAAACTTTGTTGTACCC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.109 | 0.100 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTACAAACTTTGTTGTACCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.168 | 0.060 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGTACAACAAAGTTTGTAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.169 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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