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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-25 20:58:06, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Vigna angularis var. angularis DNA, chromosome 10, almost complete sequence, cultivar: Shumari.
AP015043.1:4220876-4220895
GCCCCAGTTCTGGGCCAGGGCTTGTTGGGT4220876GCTGCCATGCACTGCTACTACAGCTGTGGAAGTGGCGAGGAATGTGGAGA
Vigna angularis mRNA, clone: VES06I10.
HX944541.1:201-220
TCTCCACATTCCTCGCCACTTCCACAGCTG201TAGTAGCAGTGCATGGCAGCACCCAACAAGCCCTGGCCCAGAACTGGGGC
Sambucus nigra genome assembly, chromosome: 12.
OX422218.1:242434744-242434763
TATGAAAATGAACATATACATGTATGCAAG242434744TAGTAGCAGTGCATGGCAGCATATATGGCAGTGTATGTAAGTTGCAACAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTGCCATGCACTGCTACTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTGCCATGCACTGCTACTA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.406 | 0.397 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTGCCATGCACTGCTACTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.591 | 0.185 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAGTAGCAGTGCATGGCAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.592 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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