GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 13:01:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES05K16, 5' end sequence.
FY384237.1:153-172
GCTGCCGTGCTCACCAATTCGGACCCAAGT153GCTGGAAGTTGCTCGTTTTCTGCAAGCTCGGGGACCTCTGGTTCTCCGAG
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CFES02A07, 5' end sequence.
FY394553.1:346-365
GCTGCCGTGCTCACCAATTCGGACCCAAGT346GCTGGAAGTTGCTCGTTTTCTGCAAGCTCGGGGACCTCTGGTTCTCCGAG
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CFES02A19, 5' end sequence.
FY394565.1:346-365
GCTGCCGTGCTCACCAATTCGGACCCAAGT346GCTGGAAGTTGCTCGTTTTCTGCAAGCTCGGGGACCTCTGGTTCTCCGAG
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CFES03P09, 5' end sequence.
FY395292.1:454-473
GCTGCCGTGCTCACCAATTCGGACCCAAGT454GCTGGAAGTTGCTCGTTTTCTGCAAGCTCGGGGACCTCTGGTTCTCCGAG
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CFES06N08, 5' end sequence.
FY396378.1:195-214
GCTGCCGTGCTCACCAATTCGGACCCAAGT195GCTGGAAGTTGCTCGTTTTCTGCAAGCTCGGGGACCTCTGGTTCTCCGAG
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CFES21P23, 5' end sequence.
FY402065.1:483-502
GCTGCCGTGCTCACCAATTCGGACCCAAGT483GCTGGAAGTTGCTCGTTTTCTGCAAGCTCGGGGACCTCTGGTTCTCCGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTGGAAGTTGCTCGTTTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTGGAAGTTGCTCGTTTTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.675 | 0.667 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTGGAAGTTGCTCGTTTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.765 | 0.090 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAAACGAGCAACTTCCAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=44
0.765 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).