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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:12:43, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B07.
CP030999.1:24830790-24830809
TAAATCTCCTTTATCTTCTGACTTAGCTTA24830790GCTTGTTTTAATTTGGGCGATTAGACACTAGCTTTTGAGATTTACCTTTC
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 07.
CP049898.1:25729560-25729579
TAAATCTCCTTTATCTTCTGACTTAGCTTA25729560GCTTGTTTTAATTTGGGCGATTAGACACTAGCTTTTGAGATTTACCTTTC
Pichia sorbitophila strain CBS 7064 chromosome D complete sequence.
FO082056.1:224374-224393
GAAGTAGTTCTATATACTGGCATGAAAAAT224374GCTTGTTTTAATTTGGGCGAAAGCATATCTCAGAAGGCTGAAACACAATT
Pichia sorbitophila strain CBS 7064 chromosome C complete sequence.
FO082057.1:216900-216919
GAAGTGGTTCTATATACTGGTATGAAAAGT216900GCTTGTTTTAATTTGGGCGAAAGTATCTCCCACAAGGTTGAAACACGATT
Monopis laevigella genome assembly, chromosome: 17.
OX375856.1:4104401-4104420
ACATTTAAACGATTTTTAAGAAATTATCTG4104401GCTTGTTTTAATTTGGGCGAACTAATTGGGAAAAATGGGTAAACTCAATT
Monopis laevigella genome assembly, chromosome: 17.
OX381593.1:4098323-4098342
ATATTTAAACGATTTTTAAGAAAATTCCTG4098323GCTTGTTTTAATTTGGGCGAACTAAATGGGAAAAATGGGTAAACTCAATT
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS47E18.
DH961642.1:497-516
GAAAGGTAAATCTCAAAAGCTAGTGTCTAA497TCGCCCAAATTAAAACAAGCTAAGCTAAGTCAGAAGATAAAGGAGATTTA
Hypena proboscidalis genome assembly, chromosome: 1.
LR990127.1:2351133-2351152
CTAACTCCTACAATCTACTGAGAAATTCCT2351133TCGCCCAAATTAAAACAAGCAATTAACATGTCAAGTCTCTTTGAATATGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTTGTTTTAATTTGGGCGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTTGTTTTAATTTGGGCGA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.172 | 0.163 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTTGTTTTAATTTGGGCGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.294 | 0.122 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCGCCCAAATTAAAACAAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=44
0.296 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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