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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 15:52:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Camellia sinensis Singletons114367.Casi mRNA sequence.
HP717101.1:205-224
CCGATTATAAAAAAATAACTCCTTTAACGA205GGAAGAGTGGGTGCGTGAAGCAAGATCAGCATCGTCGGAGA
Poecilus cupreus genome assembly, chromosome: 17.
OZ012730.1:10475304-10475323
GACACGTGCGCACGACACGTGAGGAAGCCA10475304GGAAGAGTGGGTGCGTGAAGTTGTCACTCTTCTAGTAAAATTACATTGCA
EST2320 Tender roots cDNA library of tea plant Camellia sinensis cDNA clone 07102311-CHAG_25_27.M13+_C04.ab1, mRNA sequence.
GE651993.1:291-310
GATCGATCTTCTCCGACGATGCTGATCTTG291CTTCACGCACCCACTCTTCCTCGTTAAAGGGAGGTCGCCCCACCCTGGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGAAGAGTGGGTGCGTGAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGAAGAGTGGGTGCGTGAAG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.151 | 0.143 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGAAGAGTGGGTGCGTGAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.298 | 0.147 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTCACGCACCCACTCTTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.299 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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