GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:11:04, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

ICPL20102_CW38_G03 Fusarium wilt challenged (6 DAI) pigeonpea genotype ICPL20102 root cDNA library Cajanus cajan cDNA clone ICPL20102_CW38_G03 5', mRNA sequence.
GR464289.1:126-147
CACAGAAACATTACCTACCCATCCTTTGCA126GGCTTATAGGAACAACAAGAAGCCCATATTGATTTTCATTCAAGCATTGATA
TSA: Cajanus cajan cultivar UPAS 120 contig23180.UPAS mRNA sequence.
EZ640897.1:983-1004
TATCAATGCTTGAATGAAAATCAATATGGG983CTTCTTGTTGTTCCTATAAGCCTGCAAAGGATGGGTAGGTAATGTTTCTGTG
TSA: Cajanus cajan cultivar Asha contig11709.Asha mRNA sequence.
EZ659573.1:401-422
TATCAATGCTTGAATGAAAATCAATATGGG401CTTCTTGTTGTTCCTATAAGCCTGCAAAGGATGGGTAGGTAATGTTTCTGTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGCTTATAGGAACAACAAGAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGCTTATAGGAACAACAAGAAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.272 | 0.263 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCTTATAGGAACAACAAGAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.370 | 0.098 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTCTTGTTGTTCCTATAAGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.372 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).