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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 13:56:16, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Trifolium subterraneum genome assembly, chromosome: 4.
OX637464.1:45153025-45153045
CTCGCCAAATAACACAAGAACAACAACCAT45153025GGCTTTTGGAGAATGGTGATCCAAAACGCTTGACCAAGGAAGCAAGACATG
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 07_0cc.
CP125848.1:13291952-13291972
CATGTCTTGCTTCCTTGGTCAAGCGCTTCT13291952GATCACCATTCTCCAAAAGCCATGGTTGTTCTTGTGTTATTTGGCGAGAAG
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 07_Pall.
CP125849.1:14433685-14433705
CATGTCTTGCTTCCTTGGTCAAGCGCTTTG14433685GATCACCATTCTCCAAAAGCCATGGTTGTTCTTGTGTTATTTGGCGAGAAG
Trifolium fragiferum genome assembly, chromosome: 5.
OX940793.1:17259387-17259407
CATGTCTTGCTTCCTTGGTCAAGCGCTTTG17259387GATCACCATTCTCCAAAAGCCATGGTTGTTCTTGTGTTATTTGGCGAGAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGCTTTTGGAGAATGGTGATC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGCTTTTGGAGAATGGTGATC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.164 | 0.155 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCTTTTGGAGAATGGTGATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.262 | 0.098 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATCACCATTCTCCAAAAGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.265 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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