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2026-02-27 23:06:53, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Mdfrt3031J23_e8274.g1 Mdfrt Malus domestica cDNA 5', mRNA sequence.
GO559773.1:115-137
CATTCCACAAAAAATTTAATTACACAGTTG115GGTCATCACCCACTTAAAAACCAAAAAAACAAGTTGAAAATAGACAACCAAAA
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 6.
CP141915.1:11161925-11161947
CATTCCACAAAAATTTTAATTACACAGTTG11161925GGTCATCACCCACTTAAAAACCATAAAAACAAGTTGAAAATAGACAACCAAAA
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 6.
CP141932.1:11617747-11617769
CATTCCACAAAAAATTTAATTACACAGTTG11617747GGTCATCACCCACTTAAAAACCAAAAAAACAAGTTGAAAATAGACAACCAAAA
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 9.
CP141961.1:11028844-11028866
CATTCCACAAAAATTTTAATTACACAGTTG11028844GGTCATCACCCACTTAAAAACCATAAAAACAAGTCGAAACTAGACAACCAAAA
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 9.
CP141978.1:11008811-11008833
CATTCCACAAAAATTTTAATTACACAGTTG11008811GGTCATCACCCACTTAAAAACCATAAAAACAAGTCGAAACTAGACAACCAAAA
Pyrus pyrifolia cultivar Housui mRNA, clone: TsuENH046_00124m, 5' end sequence.
AB450722.1:517-539
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTA517TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTTGTGTAATTTAAAATTTTTCTGGGA
Mdfrs3138K16.g1 Apple_EST_Mdfrs Malus domestica cDNA 5', mRNA sequence.
GO520354.1:289-311
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT289TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTA
Pyrus pyrifolia mRNA, clone: NFW1_01_57, 5' end sequence, expressed in flower bud.
HX761213.1:699-721
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTA699TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTCTGGAAT
TSA: Pyrus x bretschneideri Unigene66958_XinShao mRNA sequence.
JR653976.1:113-135
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTA113TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTCTGGAATG
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 6.
CP143363.1:23719384-23719406
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT23719384TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 6.
CP143380.1:21339007-21339029
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTA21339007TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus domestica cultivar Red Fuji chromosome 6.
CP147798.1:31568876-31568898
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT31568876TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus domestica cultivar Red Fuji chromosome 6.
CP147823.1:32182397-32182419
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT32182397TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus ioensis cultivar PI590015 chromosome 6.
CP154729.1:24394880-24394902
TTTTGGTCGTCTATTTTCAACTTGTTTTTA24394880TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus ioensis cultivar PI590015 chromosome 6.
CP154746.1:25622189-25622211
TTTTGGTCGTCTATTTTCAACTTGTTTTTA25622189TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus coronaria cultivar PI590014 chromosome 6.
CP154763.1:26515883-26515905
TTTTGGTCGTCTATTTTCAACTTGTTTTTA26515883TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus coronaria cultivar PI590014 chromosome 6.
CP154780.1:27031167-27031189
TTTTGGTCGTCTATTTTCAACTTGTTTTTA27031167TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Chaenomeles sinensis isolate sampleA chromosome 16.
CP162379.1:19969683-19969705
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTA19969683TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTCTGGAATG
Malus domestica cultivar WA 38 chromosome 6B.
CP165689.1:23622434-23622456
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT23622434TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus domestica cultivar WA 38 chromosome 6A.
CP165706.1:23807211-23807233
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT23807211TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus domestica cultivar Golden Delicious chromosome 06.
CP168770.1:23789838-23789860
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT23789838TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus domestica cultivar Golden Delicious chromosome 06.
CP168787.1:23575377-23575399
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT23575377TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAATTTTTTGTGGAATG
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 6.
OU696508.1:23715079-23715101
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT23715079TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 6.
OU696682.1:24006420-24006442
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT24006420TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 6.
OU744547.1:23757770-23757792
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT23757770TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 6.
OU744958.1:23718849-23718871
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT23718849TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAATTTTTTGTGGAATG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 6.
OU744996.1:19880265-19880287
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT19880265TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG
Malus x robusta genome assembly, chromosome: 14.
OY720338.1:19759060-19759082
TTTTGGTTGTCTATTTTCAACTTGTTTTTT19759060TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACCCAACTGTGTAATTAAAATTTTTGTGGAATG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTCATCACCCACTTAAAAACCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTCATCACCCACTTAAAAACCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.187 | 0.178 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GGTCATCACCCACTTAAAAACCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.392 | 0.206 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TGGTTTTTAAGTGGGTGATGACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.408 | 0.015 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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