GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:43:46, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Tridacna derasa genome assembly, chromosome: 13.
OY723426.1:7255115-7255134
TTTTTTTTCCCACCTGCTCTTTTCAGGAAA7255115GTCACTCAACAACGAAACCAATGATTCCCGTGATACACATGGGAAATATA
CSATR1JP_T3_007_G05_19DEC2008_025 CSATR1JP Cannabis sativa cDNA, mRNA sequence.
JK498730.1:28-47
CTGTTCAAGAATTTTTTGCATTAAAAT28TGGTTTCGTTGTTGAGTGACATTATGGCTTTAGCCTTAACCAATCTTTCG
TSA: Cannabis sativa PK16884.3_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449992.1:342-361
TTACTGTTCTAGAATTTTTTGCATTAAAAT342TGGTTTCGTTGTTGAGTGACAGTATGGCTTTAGCCTTAACCAATCTTTCG
TSA: Cannabis sativa PK16884.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP469187.1:63-82
TCACTGTTCAAGAATTTTTTGCATTAAAAT63TGGTTTCGTTGTTGAGTGACAGTATGGCTTTAGCCTTAACCAATCTTTCG
Hippopus hippopus genome assembly, chromosome: 13.
OX328108.1:45202186-45202205
TATATTTCCCATGTGTATCACGGGAATCAT45202186TGGTTTCGTTGTTGAGTGACTTTCCTGAAAAGAGCAGGTGGGAAAAAAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTCACTCAACAACGAAACCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTCACTCAACAACGAAACCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.158 | 0.149 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCACTCAACAACGAAACCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.361 | 0.203 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGTTTCGTTGTTGAGTGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.363 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).