GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 11:44:20, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Cajanus cajan cultivar UPAS 120 contig24798.UPAS mRNA sequence.
EZ642515.1:114-135
AAATAGCAATTAAACATAAATACACACATA114GTGACGAGGATATACAAATTCCAATCCACCATATATGTATAAGCAAATTAAA
Sequence 15236 from patent US 10766935.
MV658631.1:1032-1053
TTTAATTTGCTTATACATATATGGTGGATT1032GGAATTTGTATATCCTCGTCACTATGTGTGTATTTATGTTTAATTGCTATTT
Sequence 15236 from patent US 11566053.
OS282110.1:1032-1053
TTTAATTTGCTTATACATATATGGTGGATT1032GGAATTTGTATATCCTCGTCACTATGTGTGTATTTATGTTTAATTGCTATTT
Glycyrrhiza uralensis cDNA, clone: H335_D1L1_P01_P1_A01.f, 5'-end sequence.
FS238592.1:246-267
AGGCTCTTCACGCTTTATGCATGGTGGATT246GGAATTTGTATATCCTCGTCACTATGTTGTAATTTACTATTTTGCGGTAGCA
Glycyrrhiza uralensis cDNA, clone: H335_D1L1_P01_P1_G11.f, 5'-end sequence.
FS238669.1:259-280
AGGCTCTTCACGCTTTATGCATGGTGGATT259GGAATTTGTATATCCTCGTCACTATGTTGTAATTTACTATTTTGCGGTAGCA
TSA: Cajanus cajan cultivar Asha contig30484.Asha mRNA sequence.
EZ678348.1:249-270
TTTAATTTGCTTATACATATATGGTGGATT249GGAATTTGTATATCCTCGTCACTATGTGTGTATTTATGTTTAATTGCTATTT
Sphenostylis stenocarpa genome assembly, chromosome: 1.
OY731398.1:37630662-37630683
GATCTTTAATTTGCTCATACATGGTGGATT37630662GGAATTTGTATATCCTCGTCACTATGTGTGTATTTATTTATATATGTTTACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTGACGAGGATATACAAATTCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTGACGAGGATATACAAATTCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.145 | 0.136 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGACGAGGATATACAAATTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.549 | 0.404 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGAATTTGTATATCCTCGTCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.553 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).