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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:37:16, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

QGB19C20.yg.ab1 QG_ABCDI lettuce salinas Lactuca sativa cDNA clone QGB19C20, mRNA sequence.
BQ852855.1:37-61
GAAGGATCCGTTTAATTCCGGTATTCTGTA37TATCAAACGTAAAGTTGGAGCTTGTTCCTATGTGGATGACCCCATAGGACGCCAG
TSA: Lactuca sativa Letassy_X1_41 mRNA sequence.
JI573875.1:4746-4770
GAAGGATCCGTTTAATTCCGGTATTCTGTA4746TATCAAACGTAAAGTTGGAGCTTGTTCCTATGTGGATGACCCCATAGGACGCCAG
TSA: Lactuca serriola Serrassy_T_P2_64881 mRNA sequence.
JO020545.1:928-952
CTGGCGTCCTATGGGGTCATCGACATAGGA928ACAAGCTCCAACTTTACGTTTGATATACAGAATACCAGAATTAAACGGATCCTTC
Lactuca saligna genome assembly, chromosome: 2.
OX465078.1:149414389-149414413
CTGGCGTCCTATGGGATCATCCACGTAGGA149414389ACAAGCTCCAACTTTACGTTTGATATACAGGATACCCGAATTAAATGGATCCTTC
Arctium minus genome assembly, chromosome: 4.
OX941083.1:140465489-140465513
CTGGCGCCCTATAGGATCATCCACATATGA140465489ACAAGCTCCAACTTTACGTTTGATATAGAGGATACCAGAATTAAATGGATCGTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TATCAAACGTAAAGTTGGAGCTTGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TATCAAACGTAAAGTTGGAGCTTGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.195 | 0.186 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TATCAAACGTAAAGTTGGAGCTTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.299 | 0.104 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACAAGCTCCAACTTTACGTTTGATA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.301 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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