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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 18:21:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig12960, mRNA sequence.
JW063204.1:165-185
CCAATTTATTTGCTATGGGTAGCAATTTTC165TCAAGGCAATCACTACCAACCCCATGTATCCAATTATCAAATTCCTTAAAC
comvsuca1005_a08 SSH library of flowers of Capsicum - Arabidopsis Capsicum annuum cDNA 5', mRNA sequence.
EL813938.1:188-208
GTTTAAGGAATTTGATAATTGGATACATGG188GGTTGGTAGTGATTGCCTTGAGAAAATTGCTACCCATAGCAAATAAATTGG
KS19061B08 KS19 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD092916.1:434-454
GTTTAAGGAATTTGATAATTGGATACATGG434GGTTGGTAGTGATTGCCTTGAGAAAATTGCTACCCATAGCAAATAAATTGG
KS20022B11 KS20 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD095324.1:357-377
GTTTAAGGAATTTGATAATTGGATACATGG357GGTTGGTAGTGATTGCCTTGAGAAAATTGCTACCCATAGCAAATAAATTGG
KS20033D09 KS20 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD096366.1:548-568
GTTTAAGGAATTTGATAATTGGATACATGG548GGTTGGTAGTGATTGCCTTGAGAAAATTGCTACCCATAGCAAATAAATTGG
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 10, sequence.
AP026705.1:233081094-233081114
GTTTAAGGAATTTGATAATTGGATACATGG233081094GGTTGGTAGTGATTGCCTTGAGAAAATTGCTACCCATAGCAAATAAATTGG
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 10.
CP124722.1:237657507-237657527
GTTTAAGGAATTTGATAATTGGATACATGG237657507GGTTGGTAGTGATTGCCTTGAGAAAATTGCTACCCATAGCAAATAAATTGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCAAGGCAATCACTACCAACC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCAAGGCAATCACTACCAACC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.176 | 0.167 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAAGGCAATCACTACCAACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.522 | 0.346 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTTGGTAGTGATTGCCTTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.526 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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