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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 14:56:43, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:66253075-66253094
GAAAGAGATATATTATTTTCAAAAGAGATA66253075TCACTTCCTAAATCATGGACATTTCCAATAATGGGAAATACCTCTCACCC
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjT13B14, TM1164.
AP007859.2:14549-14568
GGGTGAGAGGTATTTCCCATTATTGGAAAT14549GTCCATGATTTAGGAAGTGATATCTCTTTTGAAAATAATATATCTCTTTC
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjB69N14, BM1484.
AP008107.2:128035-128054
GGGTGAGAGGTATTTCCCATTATTGGAAAT128035GTCCATGATTTAGGAAGTGATATCTCTTTTGAAAATAATATATCTCTTTC
Populus nigra genome assembly, chromosome: 11.
OX637682.1:11539750-11539769
GTTTGAGTGTTATCACCTCCCAAATCCGAA11539750GTCCATGATTTAGGAAGTGAAGAAAACACGCTCAAGGTTTAAATTGTCAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCACTTCCTAAATCATGGAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCACTTCCTAAATCATGGAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.108 | 0.100 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCACTTCCTAAATCATGGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.132 | 0.024 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCCATGATTTAGGAAGTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.135 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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