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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 08:52:43, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Theobroma cacao, mRNA sequence (KZ0AAB6YO09FM1).
CU585694.1:47-67
TTGAAATGGCAAATATCGAAATCTACAAGT47TCATAACAACAACGGATTGAGTTACATCACCTAAAATTGGCACCTAAAGAC
Theobroma cacao, mRNA sequence (KZ0AAM7YO16FM1).
CU609126.1:32-52
TTTTTTTTTTTTTTTGCGAAATCCACAAGT32TCATAACAACAACGGATTGAGTTACATCACCTAAAATTGGCACCCAATGAC
Theobroma cacao isolate Sca6 chromosome 1.
CP139290.1:3610018-3610038
TTGAAATGGCAAACATCGAAATCTACAAGT3610018TCATAACAACAACGGATTGAGTTACATCACCTAGAATTGGCACCTAATGAC
Theobroma cacao genome assembly, chromosome: I.
LT594788.1:3624707-3624727
TTGAAATGGCAAATATCGAAATCTACAAGT3624707TCATAACAACAACGGATTGAGTTACATCACCTAGAATTGGCACCTAATGAC
Theobroma cacao genome assembly, chromosome: 1.
OY284438.1:3670606-3670626
TTGAAATGGCAAACATCGAAATCTACAAGT3670606TCATAACAACAACGGATTGAGTTACATCACCTAGAATTGGCACCTAATGAC
Theobroma cacao genome assembly, chromosome: 1.
OY284448.1:3670925-3670945
TTGAAATGGCAAACATCGAAATCTACAAGT3670925TCATAACAACAACGGATTGAGTTACATCACCTAGAATTGGCACCTAATGAC
Theobroma cacao genome assembly, chromosome: 1.
OY284458.1:35572467-35572487
GTCATTAGGTGCCAATTCTAGGTGATGTAA35572467CTCAATCCGTTGTTGTTATGAACTTGTAGATTTCGATGTTTGCCATTTCAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCATAACAACAACGGATTGAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCATAACAACAACGGATTGAG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.388 | 0.380 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCATAACAACAACGGATTGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.496 | 0.108 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCAATCCGTTGTTGTTATGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=44
0.497 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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