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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:02:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Macaca fascicularis complete genome, chromosome chr2.
LT160001.1:185288623-185288642
TTACAAAGGTTTAATAATTTGAATGTTACT185288623TCCAACATCAAAGAGCCTCCTCCCTTGAACTTTCAGTGGTTACCGATTTG
Sciurus carolinensis genome assembly, chromosome: 2.
LR738591.1:167902260-167902279
ACCTGTGGGTCAGGGCCTTCACAGCCCTCC167902260TCCAACATCAAAGAGCCTCCTGCTCCTTCCCTACTGGGGGCTCCAGTACC
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES09J06, 5' end sequence.
FY385722.1:72-91
ACATCACATATTGCATCAACGAAGCTCAAA72TCCAACATCAAAGAGCCTCCACACTTTACCAGACATAATGCTTCTACATA
Acomys percivali genome assembly, chromosome: 3.
OU015744.1:82979136-82979155
CCAGGAGAGGTCTAAGTGTGTCCTCTACAA82979136GGAGGCTCTTTGATGTTGGAGGCACACTGAAGAAGAAGATGGGAGGCCCT
Andrena haemorrhoa genome assembly, chromosome: 6.
OU342945.1:27465328-27465347
GATCGAAAATTAGGAAAAGCTTAGTTTTTG27465328GGAGGCTCTTTGATGTTGGAATATGGATGAGCAATTAGGTGGAATGTATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCAACATCAAAGAGCCTCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCAACATCAAAGAGCCTCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.324 | 0.315 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCAACATCAAAGAGCCTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.417 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGAGGCTCTTTGATGTTGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.419 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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