GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-12-17 08:17:34, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Cucumis melo genomic chromosome, chr_12.
LN713266.1:20483425-20483447
GTGAATTACATTTATATGGATCCTATATAT20483425TCCATTGGTTAAAAAGAAAGACGAAATTTAGCGAAATTTTAAAAATAAAAATA
Cucumis melo genomic scaffold, anchoredscaffold00001.
LN681932.1:5916947-5916969
TATTTTTATTTTTAAAATTTCGCTAAATTT5916947CGTCTTTCTTTTTAACCAATGGAATATATAGGATCCATATAAATGTAATTCAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCATTGGTTAAAAAGAAAGACG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCATTGGTTAAAAAGAAAGACG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.373 | 0.364 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TCCATTGGTTAAAAAGAAAGACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.553 | 0.180 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CGTCTTTCTTTTTAACCAATGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.554 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).