GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-24 22:48:23, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Vigna angularis mRNA, clone: VEPS08P01.
HX941731.1:154-173
TTCCGCTCCCGTCAAGTCCCAACTGTACAA154TCCCAACCGTCAAGTTTACCGACCGCAATCCCATTACCACCGCCGAGGTC
Vigna angularis mRNA, clone: VEPS10_C05.
HX942160.1:181-200
TTCCGCTCCCGTCAAGTCCCAACTGTACAA181TCCCAACCGTCAAGTTTACCGACCGCAATCCCATTACCACCGCCGAGGTC
Vigna angularis mRNA, clone: VES10I09.
HX946056.1:200-219
TTCCGCTCCCGTCAAGTCCCAACTGTACAA200TCCCAACCGTCAAGTTTACCGACCGCAATCCCATTACCACCGCCGAGGTC
Vigna angularis mRNA, clone: VES16I03.
HX948313.1:154-173
TTCCGCTCCCGTCAAGTCCCAACTGTACAA154TCCCAACCGTCAAGTTTACCGACCGCAATCCCATTACCACCGCCGAGGTC
Vigna angularis var. angularis DNA, chromosome 2, almost complete sequence, cultivar: Shumari.
AP015035.1:4513058-4513077
TTCCGCTCCCGTCAAGTCCCAACTGTACAA4513058TCCCAACCGTCAAGTTTACCGACCGCAATCCCATTACCACCGCCGAGGTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCCAACCGTCAAGTTTACC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCCAACCGTCAAGTTTACC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.953 | 0.945 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCCAACCGTCAAGTTTACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
1.058 | 0.105 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTAAACTTGACGGTTGGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
1.058 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).