GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-08 13:41:17, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Barbus barbus genome assembly, chromosome: 30.
OW387197.1:12248479-12248498
AAAACCACTGGGATCTAAATTTGGAGGAAG12248479TGCAACCACAGATTTTAGGGATAGACGGAGTAACAGGGTTGACGGCTGTG
Lasioglossum pauxillum genome assembly, chromosome: 7.
OW121705.1:33203215-33203234
TAAATTTATGTAAAATGCGGCGTTTTTCCT33203215TGCAACCACAGATTTTAGGGCTTGAAGAATCTATCTCTTCAAGCTGTTTC
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT23J23, TM0428.
AP009974.1:30765-30784
ACACATATATATATTACATTAACCTTAAAA30765CCCTAAAATCTGTGGTTGCATCAATCCCATAATTTTAATGTGTCCTATAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:11266765-11266784
ACACACATATATATTACATTAACCTTAAAA11266765CCCTAAAATCTGTGGTTGCATCAATCCCATAATTTTAATGTGTCCTATAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGCAACCACAGATTTTAGGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGCAACCACAGATTTTAGGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.377 | 0.368 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCAACCACAGATTTTAGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.457 | 0.081 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCTAAAATCTGTGGTTGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.459 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).