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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:24:56, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Elaeis guineensis 5'-methylthioadenosine/s-adenosylhomocysteine nucleosidase 1-like protein mRNA, complete cds.
KC146052.1:805-828
TATGGAGGGAGCAGCAGTGTCTTATGTGGC805TGGCTTACTGTCAGTCCCAGCAATCTTTGTTAAAGCTGTGACAGACATTGTTGA
TSA: Elaeis guineensis isotig02831.Elguifruit mRNA sequence.
JO090084.1:813-836
TCAACAATGTCTGTCACAGCTTTAACAAAG813ATTGCTGGGACTGACAGTAAGCCAGCCACATAAGACACTGCTGCTCCCTCCATA
TSA: Elaeis guineensis isotig02833.Elguifruit mRNA sequence.
JO090086.1:498-521
TCAACAATGTCTGTCACAGCTTTAACAAAG498ATTGCTGGGACTGACAGTAAGCCAGCCACATAAGACACTGCTGCTCCCTCCATA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGCTTACTGTCAGTCCCAGCAAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGCTTACTGTCAGTCCCAGCAAT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.335 | 0.326 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGCTTACTGTCAGTCCCAGCAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.443 | 0.108 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTGCTGGGACTGACAGTAAGCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.445 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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