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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 11:41:57, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Rana temporaria genome assembly, chromosome: 11.
LR991690.1:22997217-22997236
TCAATTCCTTAGCTCAGCCCTCTCCTCTTC22997217TGGTCATTGCTGTCTGTGCTGGCCCAGCTCCTCTGCCCCTCCACAGAGCC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A07.
CP030989.1:75377470-75377489
TCTTTTAGTTTTTCCTTATTTCTCGTTTTT75377470TGGTCATTGCTGTCTGTGCTGATAGAAAACAATCAAGATATAGTAAAGTA
Terriglobus albidus strain ORNL chromosome, complete genome.
CP042806.1:2451068-2451087
ACTGGAAGCAGATCGATGCGCCAGGCGCCC2451068TGGTCATTGCTGTCTGTGCTCTGGGTAAAACCAGTGTCTGTATTGACGGC
Arachis hypogaea DNA, clone: 8iHA04J02, cultivar: YI-0311.
DE998540.1:630-649
TACTTTACTATATCTTGATTGTTTTCTATC630AGCACAGACAGCAATGACCAAAAAACGAGAAATAAGGAAAAACTAAAAGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGTCATTGCTGTCTGTGCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGTCATTGCTGTCTGTGCT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.166 | 0.157 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGTCATTGCTGTCTGTGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.254 | 0.088 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCACAGACAGCAATGACCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.255 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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